چهارپایان ویژه قرآنی
(کروموزومها)
احمد شمّاعزاده
عنوانها:
دو آیة بنیادین
روزنــة امیــــد
رهنمودهای قرآن
انــســان در قـــرآن
مراتب آفرینش
معنای انعام
افـلایـتـدبـّرونالــقـــرآن؟ تفسیرها چه میگویند؟
چهارپایان ویژه، کروموزومهایی درشتاندام
جوینده یابنده است
چهارپایان ویژه، تکثیر به روشی دیگر
دستاوردهای علمی به زبان انگلیسی
مقالهای به زبان انگلیسی پیرامون کروموزومهای درشت
نکته: کسانی که مایلند این پژوهش را به دوستان انگلیسی زبان خود معرفی کنند، میتوانند از ترجمه مختصر آن در لینک زیر بهره برداری کنند:
https://www.academia.edu/13796457/Qur_an_and_Genetic-A_miracle_of_Quran
از سالهای نوجوانی، بههنگام خواندن قرآن، هرگاه به آیههای شش سورة زمر و یازده سورة شوری میرسیدم که هر دو در مورد زادوولد مردمان است، و به مراحل جنینی آنان میپردازد، ذهنم متوجه این نکته میشد که این «انعام»، همان انعام سورة «انعام» به معنای ‹شتروگاووگوسفند› نیست؛ بلکه موجودی است که چهار دستوپا دارد و خداوند با این نامگذاری میخواهد ذهن ما را متوجه و منعطف به موضوعی کند.
دو آیه بنیادین
خلقکم من نفس واحدهثمجعل منها زوجها و انزل لکم منالانعام ثمانیهازواج یخلقکم فی بطون امهاتکمخلقاًمن بعدخلق فی ظلماتثلاث ذلکمالله ربکم لهالملک لاالهالّا هو فانّیتصرفون(زمر:6)
ترجمة واژگانی: آفرید شما را از جانی یگانه، سپس قرارداد از خود آن، جفتش را. و فروفرستاد برای شما از چهارپایان، هشت جفت. میآفریند شما را در شکمهای مادرانتان آفرینشی پس از آفرینشی، در تاریکیهای سهگانه. آن است خداوندی که پرورندة شماست. از آن اوست هستی. نیست خدایی جز او. پس به کجا میروید؟(دست به دامان که میشوید؟)
فاطرالسموات والارض جعل لکم من انفسکم ازواجا و من الانعام ازواجا یذرؤکم فیه لیس کمثله شیء و هوالسمیعالبصیر(شوری: 11)
ترجمة واژگانی: شکافندة کیهان(که با شکفتن، کیهان را ایجادکرده)، قرارداد برای شما از خودهاتان، جفتهایی؛ و از چهارپایان، جفتهایی؛ بارورمیسازد شما را در آن(چهارپایان). نیست همانند او چیزی؛ و او بسیارشنوای بسیار بیناست.
روزنه امید
ماهها و سالها میگذشت تا روزی که دایرهالمعارف «بریتانیکا» پیش رویم باز بود؛ توجّهم به چیزی جلبشد؛ و آن تصویر تشریحی کروموزوم با دو بازوی بلند (Long arms) یا پاها، و دو بازوی کوتاه (Short arms) یا دستها، و یک بخش مرکزی(centromere) بود. درست مانند ‹شتروگاووگوسفند› که چهاردستوپا دارند؛ بسیار شاد شدم و یقینکردم که معنی ‹انعام› در این دو آیه ‹کروموزوم› است؛ که این معنی با دیگرواژهها و معنای کلی این آیهها نیز همخوانی دارد و مانند ترجمههای قرآن نیست که شتروگاووگوسفند یا دامها هیچجای منطقی در این دو آیه و نیز در مراحل جنینی ما ندارند.
یاداوری: شکلی را که در زیر میبینید، شکلی نیست که در بریتانیکا هست، و از منبعی از اینترنت به تازگی گرفتهشده؛ البته این شکل گذشته از شکل کلی کروموزوم، اجزاء آن را نیز نشاندادهاست.
رهنمودهای قرآن
تا اینجا تنها نیمی از مسأله حلشدهبود؛ زیرا در آیه شش سوره زمر، اشاره به ‹هشتجفت انعام› شده؛ در حالی که انسان ‹بیستوسه جفت کروموزوم› دارد؛ ولی همین هم یک نکته است؛ زیرا اگر خداوند اشاره به 23 جفت انعام میکرد، چه بسا خوانندة امروزین قرآن کریم، خیلی زود به معنی این آیه پیمیبرد؛ ولی در آن صورت، قرآن مجید تنها یک نکتة علمی را بیانکرده و بهرة دیگری نرساندهبود. اما این کتاب آسمانی بااشاره به هشت جفت، نه تنها ما را به اهمیت کروموزومها آگاهیداده و به درون هیأت آنها واردکرده، بلکه خوانندگان خود را به اندیشیدن پیرامون این هشتجفت فراخوانده و در اصل دستورداده بروید کندوکاوکنید تا بدانید چرا توجه ویژهای به این هشتجفت دارم و ویژگیهای آنها چیست، تا در زندگیتان بهکاربرید.
از سوی دیگر، در این آیه واژه انزل (صیغة گذشتة مصدر انزال) بهکاررفته، که شگفتانگیز است. آیا خداوند این هشت جفت انعام را از فضای کیهانی فروفرستادهاست؟ توضیح آنکه:
باید بدانیم که هرگاه خداوند سبحان، خود را با عزّت و جبروت در آغاز آیهها و سورهها یادکند، میخواهد نکته و امر مهمی را به خواننده قرآن گوشزدکند. بنابراین هنگامی که «فاطرالسموات والارض» را در اول آیه، و «لیسکمثله شیء و هوالسّمیعالبصیر» را در آخر آیه میآورد؛ (یعنی نه کلمه از هجده کلمه یک آیه را به وصف خود اختصاص میدهد) نمیخواهد در آن آیه، امر سادهای را به یادمان آورد که هر بچهای هم آن را میداند (خداوند شما و چهارپایان را جفت جفت آفرید تا به این تدبیر شما را خلق بیشمارکند)، که این، وهن قرآن کریم است، و بسیار شایسته و بایسته است که از این گونه توهینها نسبت به ساحت قدسی قرآن کریم جدّاً بپرهیزیم.
نکته دیگری که میتواند علت بیان «هشتجفت» باشد، این است که این «هشتجفت» در بین کروموزومهای جن و انس مشترک باشد، زیرا در هر دو آیه، قرآن کریم مخاطب خود را مشخصنکرده، بنابراین مخاطب قرآن، هم انس و هم جن میتواند باشد؛ که قرآن برای آنان به گونهای برابر، نازل شدهاست. اگر در هر دو آیه بویژه از این دیدگاه دقیقشویم، متوجهمیشویم:
1. در این دو آیه خداوند مخاطبش را مشخص نکرده، زیرا به مایه اولیه آفرینش انس و جن (‹خاک› و ‹حرارت›) یاداور نشده، و قصد آن را دارد که نکتهای مشترک میان این دو را یادآور شود.
2. سخن از این است که خداوند از جنس خودتان (ای جن و انس) برای شما همسر آفرید؛ و تنها در هشت جفت از کروموزومهایتان با یکدیگر مشترک هستید. یعنی تداخل ژنتیکی یا آمیزش جنسی شما دو نوع، امکانپذیر نیست و برخلاف آفرینش شماست.
3. شما را در انعام (کروموزوم) کشت میدهیم و بارورمیسازیم؛ همانگونه که دانشمندان نطفه را از طریق تکثیر و تقسیم سلولی کروموزومها در درون لوله آزمایش کشتمیدهند و بارورمیسازند؛ و قرآن کریم چه واژه نیکو و مناسبی را در این زمینه برگزیدهاست:
«ذرء» و چه جمله نیکوتری: «یذرؤکم فیه»؟!!
انسان در قرآن
تاکنون کتابهای زیادی در مورد «انسان در قرآن» نگاشتهشده؛ ولی تا آنجا که دیدهشده، هیچگاه نویسندهای از این دو آیه در نوشته خود، یادنکرده است. این آیهها ما را به پژوهش در شناخت اصلیترین اجزاء شکلگیری زندگان (کروموزوم، ژن، و دی. ان. آ) تشویق، و به دانش ژنتیک رهنمون میسازد.
درست است که پایهگذار دانش ژنتیک، ‹مندل› کشیش مسیحی است؛ ولی این دو آیه نکته هایی در خود نهفتهدارند، که هنوز دانش ژنتیک به آنها دست نیافته، و بدین ترتیب ما را راهنمایی میکنند که در مورد این هشت جفت کروموزوم، به پژوهش بپردازیم و بهرهها برگیریم. هرچند اگر دانشمندان مسلمان در این دو آیه تدبرمیکردند، چه بسا پیش از مندل به دانش ژنتیک دستیافتهبودند.
مراتب آفرینش
خداوند منّان در آغاز سوره نحل، پس از اینکه میفرماید امر خداوند فرامیرسد، پس در مورد آن شتاب مکنید و فرشتگان را به وسیله کارمایهاش برای هر یک از بندگانش که بخواهد فرومیفرستد، مراتب آفرینش را با ترتیبی ویژه، و بسیار زیبا بیان میدارد:
اول آفرینش کیهان،
دوم آفرینش انسان،
سوم آفرینش چهارپایان در چهار گروه:
چهارپایان به معنای دام؛
چهارپایان برای سوارکاری و جا به جایی اشخاص؛
چهارپایان باربر و بارکش؛
چهارپایانی که آنها را نمیشناسید. (مانند کروموزمهاـ نقش کروموزومها در قرآن مرتباً پررنگ میشود. به نظرمیرسد باز هم میتوان از آنها در قرآن نشانگرفت.)
چهارم ذکر نعمتهایی همچون آب، گیاهان، میوهها تا آخر آیة 17 این سوره.
معنای انعام
از آنچه که قرآن کریم در مورد انعام به ما یاداور شده، متوجه میشویم که همگی ترجمه و تفسیرهایی که انعام را شتر، گاو، گوسفنند، وبز(دام) گرفته اند به بیراهه رفته اند. با توجه به مثالهایی که آورده، انعام شامل جاندارانی میشود که روی چهار دست و پا حرکت میکنند و مفهوم دام در زبان عربی اغنام است.
بدین ترتیب متوجه میشویم هیچیک از مفسران قرآن، به این موضوع اشراف نداشته و توج نکرده اند و موجب شده اند تا مترجمین قرآن در زبانهای مختلف از جمله زبان انگلیسی نیز، به پیروی از مفسرین به بیراهه روند.
خداوند کریم در آیات سوره نحل روی دسته بندی انعام تأکید کرده و یکی از آن دسته ها را با این توضیح که آنها را نمیشناسید، یاداورمان شده تا در فهم دو آیه مورد بحث دقت بیشتری داشته باشیم که تاکنون نداشته ایم.
افلایتدبّرونالقرآن؟ تفسیرها چه میگویند؟
الله نزّل احسنالحدیث کتباً متشابهاً مثانی تقشعرّ منه جلودالذین یخشون ربّهم ثمّ تلین جلودهم و قلوبهم الی ذکرالله ذلک هدیالله یهدی به من یشاء(زمر: 23)
آنچه که ترجمهها و تفسیرها پیرامون این دو آیه میگویند:
تفسیر مجمعالبیان طبرسی در مورد هشتجفت انعام، آنها را محل اختلافنظر بین علما دانسته و مطالبی را آورده که برخی ترجمهها از آن گرفتهشده و در اصل چیزی برای گفتن به خواننده ندارد؛ و به نحوی از کنار آن گذشتهاست.
تفسیر المیزان علامة طباطبائی
جلد 34 ص 59 ترجمة محمدباقر موسوی همدانی: «کلمة: (انعام) بمعنای شتر و گاو و گوسفند و بز است و اگر آنها را هشت جفت خوانده، به اعتبار روبرهم نروماده آنهاست».
جلد 35 ص 41 : «و معنای جمله: (جعل لکم من انفسکم ازواجاً) این شد که او شما را نروماده آفرید، تا با ازدواج آندو، مسئله توالد و تناسل و زیادشدن افراد صورت گیرد، و معنای جملة: (و من الانعام ازواجاً) این شد که چهارپایان را هم نروماده آفرید، (یذرؤکم فیه) یعنی در این قراردادن، شما را زیادکند، و خطاب در جملة (یذرؤکم) هم بانسان است، و هم بحیوان، و ضمیر (کم) که مخصوص عقلاء است بگفتة زمخشری از این جهت بهمه برگردانید که جانب انسانها را غلبه داد».
3. قاموس قرآن در زیر نعم در چند جا آوردهاست که: «شتروگاووگوسفند(انعام ثلاثه) و مفرد ندارد بلکه همواره بهصورت جمع بهکاربردهمیشود».
این نظر درست نیست؛ زیرا هرچند ‹انعام› به صورت جمع بهکاربردهشده، ولی همان جمعش نیز مفرد است؛ این موضوع را از ضمیرهایی که خداوند در مورد انعام ‹ویژه› و ‹فراگیر› بهکاربرده میتوان درککرد. تقسیمبندی 33 بار تکرار واژة ‹انعام› در قرآن از نظر نوع آن به شرح زیر است:
گونة فراگیر: شتروگاووگوسفندوبز گونة ویژه: کروموزوم
در هر آیهای که برای انعام فراگیر ضمیری بهکاربرده، ضمیر سوم شخص مفرد مؤنث است؛ مانند: والانعام خلقها لکم فیها دفء
هر آیهای که منظور آن انعام ویژه بوده، یا ضمیری ندارد؛ (البته این بدان معنا نیست که هرجا انعام ضمیر ندارد، ویژه است)؛ مانند: ثمانیه ازواج من الانعام و یا اگر دارد سوم شخص مفرد مذکر است؛ مانند: تنها آیهای که اینچنین است: و من الانعام ازواجاً یذرؤکم فیه (دلیلی محکم بر ویژهبودن برخی ‹انعام›ها در قرآن)
در هر آیهای که منظور هر دو گونة ویژه و فراگیر بوده، باز هم ضمیری بهکارنرفته؛ مانند فرقان: 49 و شعراء: 133. اینکه چرا این دو آیه به هردو گونه اطلاقمیگردد، بحث دیگری است.
‹قاموس› در ذیل بهم نیز آیات زیادی را آورده که انعام داشتهاند و آنها را از زاویههای مختلف مورد بحث قرارداده، ولی به دو آیة منظور این گفتار، هیچ اشارهای نکردهاست.
4. ترجمة الهیقمشهای:
سورة زمر: و برای شما نوع بشر هشت قسم از چهارپایان ایجادکرد.
سه اشکال این ترجمه:
‹نوع بشر› را از خود اضافهکرده و خطاب قرآن نیست.
‹ازواجاً› را به پیروی از طبرسی و بیشتر مفسرین، ‹قسم› یا ‹صنف› ترجمهکردهاشت.
‹انزل› را که به معنی ‹فروفرستاد› است، ‹ایجادکرد› ترجمهکردهاست.
سورة شوری: چارپایان را جفت (نروماده) آفرید تا به این (تدبیر) ازدواج شما را خلق بیشمارکند. در ترجمة این آیه، فیه را کاملاً از قلم انداختهاست.
5. بیان معانی مفرداتالکتابالعزیز چاپ سوریه، ناشر: دارالادیب للنشر والتوزیع:
منالانعام ازواجاً: اصنافاً ذکوراً و اناثاً. (از چارپایان نوعهایی، نرهایی و مادههایی.)
یذرؤکم فیه: یکثرکم بسبب هذاالتزویج. (بهسبب این ازدواج، شما را بیشمارکند.)
منالانعام: الابل والبقر و الضأن و المعز. (از شتر و گاو و گوسفند و بز)
این حاشیهنویسی بر قرآن، نزدیکترین است به ترجمة مرحوم الهی قمشهای؛ و معلوم میشود که پایهوبنیان ترجمهها و حتی تفسیرها، چه شیعی و چه سنی، تکرار سخن مفسرین بزرگ چندصدسال پیش است؛ و هیچ توجه ندارند که قرآن مجید با پیشرفت دانش بشری شکوفا میشود و فهمیدنیتر میگردد؛ چنانکه بههنگام اوج شکوفایی دانشها و شناختها در عصر صاحبالامر(عج)، قرآن کریم نیز به اوج شکوفایی خود خواهدرسید.
6. بهاءالدین خرمشاهی نیز در ترجمة خود چنین آوردهاست:
سورة زمر: ‹برای شما هشت قسم از چارپایان آفرید›. که شبیه است به ترجمة الهیقمشهای، و ‹انزل› را ‹آفریدن› ترجمهکرده، با این تفاوت که ‹نوع بشر› را نیفزودهاست.
سورة شوری: از چارپایان نیز انواعی قراردادهاست، و شما را در آن آفریدهاست.
در اینجا نیز مانند الهی قمشهای و دیگران زوج را ‹نوع، قسم، صنف› ترجمهکرده و ذرء به معنی ‹کشتدادن› را با ‹آفریدن›، که ترجمة ‹خلق› است جایگزینکردهاست؛ و مشخص نیست ‹در آن› به که و چه برمیگردد.
7. ترجمة زیرنویس محمدکاظم معزی:
زمر: و فرستاد برای شما از دامها هشت جفت.
شوری: و از دامها جفتهایی؛ میآفرد شما را در آن.
این ترجمه هم مانند ترجمههای پیشین، انعام را ‹دام›، و ‹فروفرستاد›(ترجمة انزل) را ‹فرستاد› (ترجمة ارسل) و یذرؤکم را ‹میآفرد› ترجمهکردهاست.
8. ترجمة زیرنویس به خط آقای مصباحزاده؛ مترجم آن مشخص نیست:
زمر: فروفرستاد برای شما از شتروگاووگوسفند هشت جفت.
شوری: قرارداد برای شما از خودتان جفتها و از شتروگاووگوسفند جفتها. بسیار میگرداند شما را در آن.
این ترجمه حتی به معنای ظاهری انعام (چهارپا) توجهنکرده، بلکه در دو آیه شتروگاووگوسفند را آورده، و معلوم نیست ‹در آن› به که و چه برمیگردد. تنها امتیاز این ترجمه آن است که انزل را درست ترجمهکردهاست.
9. ترجمة محمدمهدی فولادوند:
زمر: و برای شما از دامها هشت قسم پدیدآورد.
شوری: و از دامها (نیز) نروماده (قرارداد)، بدین وسیله شما را بسیارمیگرداند.
چهارپایان ویژه، کروموزومهایی درشتاندام
سالها گذشت تا اینکه روزی به یک دانشجوی دورة کارشناسی ارشد ژنتیک برخوردکردم و به او گفتم: «چند سالی است که به دنبال هشتجفت کروموزوم در بین کروموزومهای انسانی میگردم و میخواهم بدانم شما در مطالعههای خود تاکنون به هشتجفت کروموزوم برخوردکردهای که ویژگی خاصی داشته و آنها را از دیگرکروموزمها ممتازکردهباشد؟ و برای اینکه از پرسش من شگفتزده نشود موضوع را با او درمیانگذشتم. او پاسخ داد: «بله وجوددارد»؛ و من بسیار شاد شدم. از آن دانشجو توضیح خواستم. وی توضیح زیر را بیانکرد و کتابی را در این زمینه به زبان انگلیسی معرفینمود با عنوان Gene seven نوشتةB. Levin:
«انسان 23 جفت کروموزوم دارد که یک جفت بیستوسوم جنسی و 22 جفت دیگر غیرجنسی هستند. از این بیستودوجفت، هشتجفت یعنی کروموزومهای شمارة یک تا شمارة هشت را کروموزمهای درشتاندام(Giant Chromosome) گویند، که وظیفه تولید پروتئینهای اصلی ساختمان بدن را برعهده دارند. جهش در این هشتجفت کروموزوم معمولاً غالب است و موجب حذف کامل یک صفت میگردد».
پس از مدتی کتاب را بهدستآوردم ولی مطلبی را که به ویژگیهای این کروموزومهای درشتاندام بپردازد، پیدانکردم. به بخش ژنتیک دانشگاه تهران رفتم و موضوع را با رئیس بخش درمیانگذاشتم؛ ولی ایشان نیز اظهاربیاطلاعیکرد.
تنها چیزی که درست بود و نقشههای ژنهای انسانی یا ‹ژنوم انسان›، گویای آن است و همه آن را قبولدارند، و همه میتوانند آن را ببینند، این است که کروموزومهای یک تا هشت بسیاردرشتاند؛ و دریغا، که تاکنون پژوهشی ویژه پیرامون آنها از سوی ژنتیکدانی صورتنگرفتهاست.
جوینده، یابندهاست
پس از گذشت چندین و چند ماه در روز هجدهم دیماه هشتاد و چهار به ذهنم رسید واژه giant chromosome را در اینترنت جستوجوکنم؛ این کار را کردم و با شگفتی تمام با سه مطلب زیر روبهروشدم، وآگاهییافتم که نامسلمانان مانند موارد دیگر پیش از ما مسلمانان که به قرآن بیتوجهیم، به برخی ویژگیهای این نوع از کروموزومها دستیافتهاند؛ که برخی پژوهشهایشان در این مورد به سال 1939 بازمیگردد، ولی بیشترین یافتهها و نیز جایگیری آنها در اینترنت، مربوط به سالها و بلکه ماههای اخیر است؛ که البته این کروموزومهای ویژه هنوز جای کار بسیار دارند.
-Chromosome 6, a giant chromosome that plays an essential …
- Chromosome 6, mapped.
از جملههای آغازین این دو مطلب مشخصمیگردد که یکی از ویژگیهای نقشآفرین کروموزوم شمارة 6 را که بسیار هم ضروری است، کشفکرده و نقشة آن را نیز کشیدهاند. نقشة کروموزوم شمارة 6 را نگاهکردم، ولی بهرهبرداری مستقیم از مقالة بالا ممکن نشد.
مطلب سوم زیر عنوان ‹پلنت پلیتن کروموزوم› پژوهشهایی را که تاکنون روی ‹کروموزومهای درشت› صورتگرفته، به گونهای گسترده، بررسیمیکند. این پژوهش در سال 2000 پایان پذیرفته ولی تاریخ ورودش به اینترنت احتمالاً سال 2005 است. زیر بخشهای مهم آن را خطکشیده، و برخی واژههای مهمتر را درشت کردهام، که نظر به مفصلبودن، در پایان گفتار به صورت پیوست خواهدآمد. ترجمة دو پاراگراف برگزیده از این مقاله برای نشاندادن بخشی از اهمیت این نوع کروموزومها در اینجا آوردهمیشود:
Nag et al. (1985) described polygene chromosomes as giant chromosomes produced by changes in the mitotic cycle during the interphase stage. In such a modified nuclear cycle, the chromatin duplicates its DNA content during the G1 and S stages, but, instead of passing to the G2 stage, the nucleus initiates a new G1 phase, thus starting a new cycle of chromatin duplication. This type of cycle was first described in 1939 by Geitler.
Polytene chromosomes are structures found in highly specialized tissues in some animal and plant species, which are amplified through successive cycles of endoreduplication, finally producing several copies of each chromosome. For this reason, they have been very important in elucidating chromosome fine structure and physiology, especially in diptera.
ترجمه: ارنست نایگل دانشمند تطورگرا در سال 1985 توضیحداد که ‹پولیتن کروموزومها› یعنی کروموزومهای درشت با دگرگونیهایی در دورة میتوز، در طول مرحلة بینفازی، تولیدمیشوند. هستة این کروموزومها با سپریکردن کامل روش تقسیم سلولی تکثیر و بارور نمیشود؛ بلکه کروماتین موجود در دی. ان. آ. خود را در طول مرحلههای جی1 و اس، دوبرابر میکند؛ ولی بهجای گذر به مرحلة جی2، مرحلة جی1 تازهای را آغازمیکند؛ و بدین ترتیب دورة تازهای از دوبرابرشدن کروماتین آغازمیگردد. این گونه چرخة تولید، اولین بار در سال 1939 به وسیلة ‹گیتلر› تشریحشد.
با خواند این جمله ها اکنون متوجه میشوید که چرا قرآن کریم گفته بود "شما را در انعام(کروموزوم) کشت میدهیم و بارورمیسازیم؛ و قرآن کریم چه واژة نیکو و مناسبی در این زمینه برگزیدهاست: «ذرء» و چه جمله نیکوتری: «یذرؤکم فیه»."
‹پولیتن کروموزومها› ساختارهایی هستند که در برخی گونههای جانداران و گیاهان تودههای ویژهای از تخمها را به گونهای اساسی بنیانمینهند؛ که با سیر موفقیتآمیز دورههای تکثیرشدن درون سلولی تقویتشدهاند، و در نهایت از هر کروموزوم، به تعداد زیادی تکثیرمیشود. به همین دلیل آنها در روشنشدن روند سازوکار و ساختار خوب کروموزوم نقش بسیار مهمی دارند. (بویژه در تولید مثل مگسهای دوبال)
چهارپایان ویژه، تکثیر به روشی دیگر
از مقالة ‹پولیتن کروموزوم› که تاریخچة پژوهشهای صورتگرفته برروی ‹کروموزومهای درشت› همراه با حدود هشتاد مقالة رفرانس است و دو پاراگراف آن ترجمهشد، مشخصگردید نظر به اینکه روند تکثیر کروموزومهای درشت، همانند دیگر کروموزومها نیست، پژوهشهای ژنتیکی پیرامون ‹کروموزومهای درشت›، بیشتر با عنوان ‹پولیتن کروموزم› که نشان دهندة روش تکثیری آنهاست، صورتمیگیرد؛ در نتیجه نگارنده دریافت درصورتیکه polytene chromosome را در اینترنت جستوجو کنیم، به ویژگیهای ‹جاینت کروموزومها› و پژوهشهای صورتگرفته پیرامون آنها بهتر و بیشتر آگاهی مییابیم. این کار صورتگرفت و دیدهشد که چه بسیار پژوهشهایی که پیرامون آنها صورتگرفته و میگیرد و متأسفانه ژنتیکدانان کشورمان نسبت به آنها چندان توجهی ندارند.
دستاوردهای علمی به زبان انگلیسی
در یکی دیگر از روزهای دیماه 84 نیز مقالهای را از پایگاه بی. بی. سی. برگرفتم که رویGiant chromosome بیشتر پژوهشکرده و بیشتر به موارد بیماریزا پرداختهاست. این مقاله گذشته از اینکه نقش و اهمیت این نوع کروموزومها را بهتر مینمایاند، از نظر شناخت و درنتیجه درمان بیماریهای انسان، دستاوردهای بسیارمهمی را به همراه دارد.
موارد مهم را با زیرخطکردن مشخصکردهام و موارد مهمتر بویژه از نظر شناخت بیماریها در یکی از این نوع کروموزمها (شمارة 5) را با خط کشی و نیز درشتکردن، نشاندادهام:
Human genome hits halfway mark
Human chromosomes: Cracking the human code has been a bit like painting a picture
Four years after publishing a draft of the human genetic sequence, researchers have hit the halfway mark in producing the "gold standard" version.
They have just published a detailed run-down of a 12th chromosome - known as chromosome five - which means there are just 12 left to complete.
Chromosome five is the largest so far, with 923 recorded genes, of which 66 are involved in human disease.
The chromosome, which was sequenced by US scientists, is detailed in Nature.
It is the second of three chromosomes that the Department of Energy Joint Genome Institute (JGI) has finalised in collaboration with colleagues at the Stanford Human Genome Center (SHGC)
Code breakers
Cracking the human code has been a bit like painting a picture. First comes a rough sketch followed by a slightly fuller version before, finally, the minute detail is added.
When the draft version of the human genome was unveiled in June 2000, 97% of the "book of life" had been read. Then, last year, scientists announced the decoding was almost 100% complete.
Now, several institutions around the world have divided up the 24 human chromosomes - the cellular structures into which DNA is wound - and are going through them with a fine-tooth comb for a final time, to fill gaps and correct errors.
This extremely accurate sequence will be a powerful tool for scientists trying to understand human disease
Spencer Abraham, Secretary of Energy
They are, as it were, dotting the I's and crossing the T's and giving the whole sequence a thorough spell-check.
"It is about getting everything in the right order," commented Dr Tim Hubbard, of the Human Genetics group at the Sanger Institute in Cambridge, UK.
"In the draft version there were 100,000 gaps in the whole genome. It was a small percentage of the sequence, but it meant you were uncertain about the order of the pieces.
"It is important for doing experiments to have the complete sequence - to have no gaps at all."
Giant chromosome
According to researchers at the JGI and SHGC, the landmark chromosome five is a genetic behemoth, containing key disease genes and a wealth of information about how humans evolved.
"This extremely accurate sequence will be a powerful tool for scientists trying to understand human disease," said US Secretary of Energy, Spencer Abraham.
DNA IN HUMAN CELLS
The double-stranded DNA molecule is held together by chemical components called bases
Adenine (A) bonds with thymine (T); cytosine(C) bonds with guanine (G)
These letters form the "code of life". There are estimated to be about 2.9 billion base-pairs in the human genome wound into 24 distinct bundles, or chromosomes
Written in the DNA are about 30,000 genes, which human cells use as starting templates to make proteins. These sophisticated molecules build and maintain our bodies
The giant chromosome is made up of 180.9 million letters - the A's, T's, G's and C's that make up the genetic code.
Of the 923 genes that sit on chromosome five, 66 are known to be linked to disease when they go wrong. Another 14 diseases seem to be connected to chromosome five genes, but they have not been linked to specific genes yet.
Having a detailed picture of chromosome five will be an immense help to researchers investigating these illnesses.
"It is very useful to have a base sequence which you can then compare individuals to," Dr Hubbard told BBC News Online.
"Then you can look for key differences between people that do have the disease and people that don't have the disease."
Another feature of chromosome five will pique the interest of scientists studying the difference between humans and chimpanzees.
Despite great similarities between the genomes of the two species, there are some key structural variations.
In particular, one large section of chromosome five is flipped backwards in humans compared with chimps.
Such an inversion makes it impossible for the two chromosomes to pair up during reproduction, which could have driven a wedge between the evolving ancestral populations.
'Junk' DNA
It is not just the genes in chromosome five that the scientists are interested in. Volumes of genetic material lie in between the genes, which for a long time were dismissed as "junk" by researchers.
But on closer inspection, it seems this judgement was premature. The fact that sequences of junk were conserved for hundreds of generations suggests they have a function worth holding on to.
"Important genetic motifs gleaned from vast stretches of non-coding sequence have been found on chromosome five," said Eddy Rubin, JGI's director.
"Comparative studies conducted by our scientists of the vast gene desert... have shown these regions, conserved across many mammals, actually have a powerful regulatory influence."
Over the next few months, the remaining 12 human chromosomes should be completed to a final gold standard of accuracy.
Dr Hubbard concluded: "Several groups are working on the remaining chromosomes - tidying them up - and they should all be complete by the end of the year."
پیوست چهارپایان ویژه قرآنی:
متن انگلیسی پیرامون کروموزومهای درشت
مطلب زیر با عنوان ‹پلنت پلیتن کروموزوم› پژوهشهایی را که روی ‹کروموزومهای درشت› صورتگرفته، به گونهای گسترده، بررسیمیکند. این پژوهش در سال 2000 پایان پذیرفته ولی تاریخ ورودش به اینترنت احتمالاً سال 2005 بوده است:
Plant polytene chromosome
By: Gianna Maria Griz Carvalheira
Laboratَrio de Citogenética Vegetal, ءrea de Genética, Departamento de Biologia, UFRPE, 52171-030 Recife, PE, Brasil. E-mail: carva@elogica.com.br
INTRODUCTION
Polytene chromosomes are structures found in highly specialized tissues in some animal and plant species, which are amplified through successive cycles of endoreduplication, finally producing several copies of each chromosome. For this reason, they have been very important in elucidating chromosome fine structure and physiology, especially in diptera.
In plants, polytene chromosomes have been observed in only a few species, and seemed to be restricted to ovary and immature seed tissues, e.g., in Phaseolus coccineus and P. vulgaris (Nagl, 1981), until relatively recently, when they were observed in the cells of the anther tapetum of Vigna unguiculata (Guerra and Carvalheira, 1994) and of some Phaseolus species (Carvalheira and Guerra, 1994). With the discovery of the polytenics in tapetum tissue, it was observed that in many other species of various angiosperm families the tapetal cells also display polytene, polyploid or both types of nuclei. In some species of Phaseolus and Vigna the polytenics are more clearly defined and, therefore, better suited to the study of this type of chromatin organization. It is, however, important to differentiate between the nuclear cycles that result in polyploid nuclei and those that produce polytene nuclei, because these two terms of the nuclear types are often used indiscriminately in the literature. In this paper some aspects of the occurrence of plant polytenes will be summarized along with the structure and function of these chromosomes.
ENDOMITOSIS AND ENDOREDUPLICATION
Nagl et al. (1985) described polytene chromosomes as giant chromosomes produced by changes in the mitotic cycle during the interphase stage. In such a modified nuclear cycle, the chromatin duplicates its DNA content during the G1 and S stages, but, instead of passing to the G2 stage, the nucleus initiates a new G1 phase, thus starting a new cycle of chromatin duplication. This type of cycle was first described in 1939 by Geitler, as occurring in the somatic cells of the insect Gerris lateralis (Painter and Reindorp, 1939; D''''''''''''Amato, 1964), and was named the endomitotic cycle because it develops within the nuclear envelop without either achromatic spindle formation or nuclear or cellular division (Nagl, 1970a; Brodsky and Uryvaeva, 1985). The term endomitosis is, however, generally used to describe the formation of both polyploid and polytene nuclei (q.v. Nagl, 1974). Nagl (1978, 1981, 1987) has suggested the term endocycle rather than endomitosis, and D''''''''''''Amato (1984) has adopted the term endomitotic and endoreduplication to distinguish between those that produce polyploid and polytene nuclei, respectively.
The endomitotic cycle (endomitosis) starts with a normal prophase (endoprophase), after which the chromosome contracts further (endometaphase), their sister chromatids separate from each other (endoanaphase) and decondense to assume the interphase nuclear structure, resulting in polyploid cells, with double the chromosome number (endopolyploidy) at the end of each cycle. The essential difference between endomitosis and the normal cell cycle is the absence of nuclear membrane dissolution in endomitosis, with the whole cycle occurring inside the nucleus. Such cycles have been observed in the anther tapetum of some angiosperm species, as in some Passiflora species and in Papaver rhoeas ( Figure 1a ).
The endoreduplication cycle differs from endomitosis because it results in polytene cells (cells with many identical paired chromatids). In the endoreduplication cycle, the chromatid number is duplicated, but they do not segregate, and after various endoreduplication cycles, larger and thicker chromosomes are produced, called polytenics. In the endoreduplication cycle, the condensation and decondensation stages are not evident (DAmato 1984, 1989), except in some cells where it is possible to see the chromocenter dispersion phase, known as the Z-phase (Nagl, 1970b, 1972; Cavallini et al., 1981).
Depending on the behavior of the sister chromatids, polytene nuclei can be divided into two structural types. The first, and most well studied, are the chromosomes of the larval cells of Drosophila, Chironomidae and other diptera (Ashburner, 1970; Brodsky and Uryvaeva, 1985). These polytenics are characterized by numerous transverse bands along their linear axis, produced by the exact pairing of sister chromatids and the intimate association of their chromomeres (Ashburner, 1970). The somatic pairing of homologous chromosomes gives the false impression that there has been a decrease in chromosome number, because each nucleus appears to contain the haploid number of giant chromosomes.
The other structural type of polytene nuclei also has the grouping of sister chromatid bundles resulting from several endoreduplication cycles, but in this case is characterized by the lack of any intimate pairing of the chromatids ( Figure 1b ). This nucleus type is observed more frequently, typical examples being found in the giant trophoblast cells of mammals (Nagl, 1985), the trophocit cells of many insects (Painter and Reindorp, 1939), some ovary tissues during the development of many angiosperms (Corsi et al., 1973; Nagl, 1976) and in the anther tapetum of some plant species (D''''''''''''Amato, 1984; Guerra and Carvalheira, 1994; Carvalheira and Guerra, 1994, 1998). In these nuclei, which can be recognized both by the large size of their chromocenters and by the diploid number of polytene chromosomes, the chromosome number does not appear to be reduced as in polytene-type nuclei. Another peculiar giant chromosome type, which likewise does not present somatic pairing, has been found in some ciliates (e.g., Stylonychia mytilus) that have a macronucleus with polytene chromosomes and a diploid micronucleus (Ammermann, 1971; Ammermann et al., 1974). The polytenics of these ciliates display band and interband patterns (also seen in Drosophila), but the macronucleus disintegrates after its development while the micronucleus remains active.
It is interesting to note that the endocycles are not processes of cell multiplication but are associated with cell differentiation and seem to be genetically controlled, with both endopolyploidy and polyteny leading to cell specialization in certain tissues. These nuclei have generally been observed in ephemeral tissues made up of only a few cells with intense metabolic activity, the main function of which is to provide nutritional support to vital organs during certain periods of development (e.g., the larval salivary glands of insects, the mammalian trophoblasts and the embryo suspensor cells of angiosperms). In such tissues, the cytoplasmatic volume and nuclei DNA content of the cells are increased by endomitosis or endoreduplication cycles (Nagl, 1974, 1985; Nagl et al., 1985).
OCCURRENCE OF POLYTENE CHROMOSOMES
Polytene nuclei were first observed in the larval salivary glands of Chironomidae, by Balbiani in 1881, but only at the beginning of the 1930s did Heitz and Bauer & Painter, independently and simultaneously, rediscover these enormous nuclei in the Malpighian tubules of Bibio hortulanus and in the larval salivary glands of Drosophila melanogaster, respectively (Ashburner, 1970). A few years later, Koltzoff, in 1934, and Bauer, in 1935, proposed the term polytenics for the giant chromosomes observed in these nuclei (Ashburner, 1970); polytene cells have since been described in many species (Nagl, 1978; Brodsky and Uryvaeva, 1985; Carvalheira and Guerra, 1998).
In plants, the first giant nuclei were observed by Osterwalder in 1898, in the enormous antipodal cells (antipodes) of the embryo sac of Aconitum (Nagl, 1981). However, as with the discovery of the giant cells of Chironomidae, the antipodal nuclei were largely forgotten for about 60 years. Only in 1956 did Tschermack-Woess and collaborators, during a reappraisal of the genus Aconitum genus and other plant species, recognize that the chromosomes observed in the antipodes were polytenics (Nagl, 1981). Unlike Drosophila polytene chromosomes, which present numerous bands and interbands, plant polytenics have a granular and fibril structure with no distinct bands (see Figure 1 ). This structure probably occurs because of the absence of intimate synapsis between the sister chromatids. It is also believed that the chromocenter dispersion phase (Z phase) has some influence on the morphology of plant polytenics, as it results in a slight separation of these chromatids (Nagl, 1970a). However, Nagl (1969a) has reported that in Phaseolus vulgaris the structure of polytene chromosomes of embryo suspensor cells seems to be altered when these cells are submitted to low temperatures, becoming partly compacted and forming bands similar to those seen in Drosophila. Such results have not been observed again, remaining the only report of plant polytenics with bands and interbands.
Since the discovery of the polytene nuclei in antipodes, many other tissues composed of polytene cells have also been described ( Table I ). It is interesting to note that, until very recently, the cells with polytene chromosomes seemed to be limited to ovary tissues (antipodal cells, synergids, endosperm and embryo suspensor cells); however, polytenics have now been observed in anther hair, glandular hair and anther tapetal cells ( Table I ).
Polyteny can also be induced in vitro and it has been found that the meristematic tissues of root tips and the cotyledon cells of some plant species are able to form polytene chromosomes when submitted to specific treatments, including high temperatures (Shang and Wang, 1991) or an appropriate amount of certain growth regulators (mainly auxin and cytocinin) in the medium (Marks and Davies, 1979; Therman and Murashige, 1984).
POLYTENE CHROMOSOMES OF EMBRYO SUSPENSOR
The most widely studied plant tissues with polytene cells is the Phaseolus embryo suspensor tissue. This tissue is found in the developing ovary of several angiosperm species (Esau, 1974). In P. coccineus and P. vulgaris, the suspensor is composed of about 200 cells, distributed between the basal and junction regions. The basal region is formed of about 20 giant mononucleate cells with a high level of polytenization, and with the DNA content of some cells being up to 8.192 C (Brady, 1973a,b). The junction region is composed of about 180 cells linking the basal region to the embryo proper. This last region possesses polyploid cells and/or cells with low polyteny level (Brady and Clutter, 1974).
The embryo suspensor provides nutritional support for the immature embryo, supplying proteins or synthesizing the substances necessary for embryo development (Schulz and Jensen, 1969). The underdevelopment of the cell wall of suspensor cells and their other structural characteristics indicate their secretory function in transporting nutrients through their membranes to the embryo (Nagl, 1974; Cionini, 1987). Analyses of the growth regulator level and transcription activity indicate that the suspensor tissue may play an important role during embryo ontogenesis, and seems to have a function in the synthesis of phytohormones needed for embryo development (Walbot et al., 1972; Clutter et al., 1974; Alpi et al., 1975; Cionini et al., 1976; Lorenzi et al., 1978).
The basal cells of the embryo suspensor tissue of P. coccineus display 22 polytene chromosomes that are up to 30 times larger than the mitotic ones (Nagl, 1974), the 11 chromosome pairs having been identified earlier by their heteropycnosis pattern (Nagl, 1967). All mitotic chromosomes present heterochromatic centromeric bands and some weak interstitial and terminal ones (Schweizer and Ambros, 1979). Staining with the fluorochromes CMA and DAPI has revealed that most of these bands are CMA+, although unlike mitotic bands they contain a small amount of DAPI+ heterochromatin (Schweizer, 1976). The difference observed in the fluorescent pattern has been attributed to the better structural resolution of the giant chromosomes.
In situ hybridization experiments, with isotopic (q.v. Schumann et al., 1990) and non-isotopic markers (q.v. Nenno et al., 1994), have contributed considerably to the characterization of polytenics. These techniques have permitted both the location of many of their DNA sequences and the study of their replication cycle (Brady and Clutter, 1974). For example, the cytolocalization of the ribosomal genes in P. coccineus has been demonstrated by the use of RNAr-H3, revealing RNA puff activity both in satellite pairs and in the heterochromatin of chromosome pairs, without satellites (Avanzi et al., 1971, 1972; Durante et al., 1977). Isotopic techniques have also made it possible to observe the extra nucleoli associated with the telomeres of the polytenics without satellites, suggesting the existence of amplification in this region (Nagl, 1973). Actually, the extra DNA synthesis in the polytenics of the Phaseolus suspensor occurs at the beginning of embryogenesis and not simultaneously with the endoreduplication cycles (Avanzi et al., 1970). Such gene amplification can occur both in the ribosomal cistrons and other regions of the genome and involves some polytene chromosome chromatids (Cremonini and Cionini, 1977). Some of these amplified regions are released from the polytenics to form micronucleoli. According to Avanzi et al. (1971), the micronucleoli are composed of a spherical mass of ribonucleoprotein covered by a layer of DNA. These micronucleoli seem to be associated with the intense metabolism of the suspensor basal cells (Nagl, 1973).
With advances in the fluorescence in situ hybridization technique (FISH), several other sequences have been located in plant polytene chromosomes. The first genic sequence hybridized in polytenics was that of the phaseolin group (Schumann et al., 1990; Nenno et al., 1993, 1994). This gene encodes the main seed storage protein of Phaseolus species. In these papers, it was demonstrated that the phaseolin gene seems to be located in chromosome 7 of P. coccineus. Another gene that has been located in the polytenics of P. vulgaris is the PGIP gene which encodes for polygalacturonase-inhibiting protein, a cell wall protein that specifically inhibits fungal endopolygalacturonases that are important during the early stages of plant pathogenesis. The PGIP gene has been located in a single region of the pericentromeric heterochromatin of the chromosome pair X, next to the euchromatin (Frediani et al., 1993).
The FISH technique as applied in polytene chromosomes has also been a useful tool to study gene evolution. Nagl (1991) hybridized telomeric DNA and the aromatase gene sequence (both from human genome) in P. coccineus and P. vulgaris polytenics. The results showed that these sequences also hybridize with plant chromosomes, supporting the hypothesis of the evolutionary conservation of important coding or non-encoding sequences throughout living organisms.
POLYTENE CHROMOSOMES OF ANTHER TAPETUM
Polytene chromosomes are also observed in other plant tissues, of which the anther tapetum tissue has made valuable contributions to the understanding of polytenics in angiosperms. This tissue is widely conserved, being found in groups ranging from bryophytes to angiosperms (Pacini and Franchi, 1993).
The tapetum is the innermost layer of the anther wall in close contact with the pollen grains ( Figure 1c ). It is generally composed of a simple layer of cells, characterized by the presence of dense cytoplasm and quite a well-developed nucleus (Echlin, 1971). During the differentiation of the tapetum, the cells increase both their cytoplasmatic and nuclear volume and then undergo autolysis and degenerate (Mascarenhas, 1990). The tapetum''''''''''''s function seems to be related to the maturation of pollen grain, with biochemical and cytological studies demonstrating the intense metabolic activity in its cells at the end of the tetrad stage and during exine formation (Rowley, 1993).
Until recently, most of the information on the nuclear development of the tapetal cells has come from studies of anther ontogenesis, based on histological analyses by optical or electronic microscopy. Cytological analyses in tapetum were done mainly by Cooper (1933), Brown (1949), Oksala and Therman (1977), Franceschi and Horner (1979), and D''''''''''''Amato (1984, 1989). However, cytogenetical analysis of the tapetal cells of Vigna species has revealed that this tissue can present very peculiar characteristics (Guerra and Carvalheira, 1994). Anther tapetum cells are characterized by the presence of endomitotic or endoreduplication cycles (Cooper, 1933; D''''''''''''Amato, 1984, 1989; Malallah et al, 1996). In species where the tapetum layer is composed of mononucleate cells, the increase in DNA content is generally a consequence of several endoreduplication cycles, while in species with bi- or multinucleate cells in the tapetum it is the endomitotic cycle which is responsible. In spite of the endoreduplication cycle producing mononucleate cells, tapetal binucleate cells with polytene nuclei have sometimes been observed (Carvalheira and Guerra, 1994).
In general, at the beginning of meiosis, the tapetal cells are mononucleate and diploid. During the tapetal differentiation, three cellular types can be observed, i.e. multinucleate cells, with more than one diploid nucleus (Malallah et al., 1996), mononucleate cells, with a single polyploid nuclei (Carvalheira, G.M.G. and Guerra, M., unpublished data), and mono- or binucleate cells, with one or two polytene nuclei (Carvalheira and Guerra, 1994). In each of these cases, the DNA content per cell is often increased, suggesting that this tissue needs several copies of most genes to supply specific substances for exine development and consequent pollen grain maturation.
The increase in the ploidy level is probably caused either by suppression of anaphase movement (producing a dumbbell-shaped polyploid interphase nucleus) or by the occurrence of endomitotic cycles (DAmato, 1989), while the increase in the number of nuclei per cell is due to the occurrence of one or more mitosis cycles without cytokinesis, resulting in multinucleate cells. Polytene nuclei, on the other hand, are formed through the endoreduplication cycles, and could remain in the interphase stage until the S phase, or progress to the prophase stage and return to a new G1 phase (Guerra and Carvalheira, 1994).
Analysis of both ploidy level and nuclear structures in tapetal cells in genera of several subfamilies has revealed that their chromatin structure may be constant at the genus level. In the family Scrophulariaceae, for example, some species of the genera Pedicularis and Melampyrum have tapetal cells with tetraploid nuclei, in the post-meiotic period. On the other hand, in this same family, the genera Odontetis, Euphrasia and Bellardia have nuclei with enormous chromocenters, but with the same ploidy level (Greilhuber, 1974).
Like the other plant tissue with polytene chromosomes, anther tapetum cells can display polytenics that vary in structure and morphology from species to species (q.v. Nagl, 1974, 1981; Carvalheira and Guerra, 1994, 1998). For example, polytene nuclei in the antipodes of Papaver rhoeas were classified by Nagl (1981) into four different types, i.e., nuclei with chromocenters associated with radial chromatin bundles; decondensed nuclei with isolated chromatin fibers; nuclei with condensed chromatin, and nuclei with polytenics proper. Similar variation was found in suspensor cells of Phaseolus embryos, where the polytenics sometimes had granular or fibril form, depending on the degree of contraction in the interchromomeres (Nagl, 1978).
According to Carvalheira and Guerra (1998), the chromatin structure of the polytene nuclei in tapetal cells may basically be divided into three different types:
1. Individualized polytene chromosomes whose chromatin bundles are heteropycnotic in the proximal region and dispersed in the distal region ( Figure 1d ), characteristic of Phaseolus coccineus, P. vulgaris (Carvalheira and Guerra, 1994), Vigna unguiculata (Guerra and Carvalheira, 1994; Carvalheira and Guerra; 1998), V. umbellata, V. radiata (Carvalheira and Guerra, 1998), Lathyrus and Sesbania marginata.
2. Polytene nuclei with chromocenters associated with the chromatin bundles ( Figure 1e ), found in most of the species analyzed, including Arachis hypogeae, Caesalpinea echinata, Clitoria cajanifolia, Crotalaria retusa, in three Habenaria species, Luffa cylindrica, Macroptilium peduncularis, two Phaseolus species (Carvalheira and Guerra, 1994), Pithecellobium dulce, Pisum sativum, Sophora tomentosa, Tropaeolum majus and Zomicarpa riedeliana.
3. Polytene nuclei with chromocenters unassociated with chromatin bundles ( Figure 1f ), a less frequent type, characteristic of Genipa americana, Indigofera hirsuta, Lupinus polyphyllus, Vigna vexillata (Carvalheira and Guerra, 1998) and Vicia sp.
Of these three types of chromatin organization, only the first is ideal for karyological analyses. The polytenics of this group is generally individualized and condensed. This type of chromatin organization has allowed good chromosome spreads to be obtained, facilitating the chromosome counting. In most Phaseolus and Vigna species analyzed that had this type of organization, it was possible to observe all 22 chromosomes of the karyotype (q.v. Guerra and Carvalheira, 1994; Carvalheira and Guerra, 1994).
Although this type of chromatin organization seems to be ideal for karyological analyses, these polytene chromosomes are somewhat smaller than those observed in the embryo suspensor of Phaseolus or those of some other genera (compare Figure 1b and d ). The largest polytenics of the anther tapetal cells (observed in Vigna unguiculata) are about 3.5 times bigger than the mitotic ones (Guerra and Carvalheira, 1994). The difference in size observed between polytenics of the embryo suspensor and anther tapetum is probably related to the number of endoreduplicated cells present in each of these tissues. As was mentioned previously, only a few basal cells undergo many endoreduplication cycles in the embryo suspensor tissue (Nagl, 1981), while in the anther tapetum hundreds of cells undergo this process. The low level of chromatin endoreduplication associated with a large number of cells seems to satisfy the metabolic necessities of both the anther tapetum and microspores. On the other hand, in the giant cell of the embryo suspensor, many endoreduplication cycles seem to be necessary to maintain the perfect functional and nutritional stage of the embryo, most of whose nutrients are supplied by the suspensor cell.
Although the polytenics of the anther tapetum are reduced in size, they have helped in the cytolocalization of DNA sequences. The first in situ hybridization in tapetal polytenics has revealed interesting data different from that which was observed in the polytene chromosomes of the embryo suspensor (Guerra and Kenton, 1996). As stated earlier, after in situ hybridization with the human telomere DNA probe, Nagl (1991) observed that the embryo suspensor polytenics of Phaseolus show a group of dots or compact bands at the telomeres. However, when synthetic telomere oligomers were hybridized with tapetum polytenics in an amphidiploid hybrid of Phaseolus, the oligo was preferentially located at, or close to, the chromocenters. These fluorescent areas were distributed randomly in the nuclear area, although association with the nuclear boundary was never observed (Guerra and Kenton, 1996). This may suggest that, at least in some aspects, the basic molecular organization of diploid nuclei in the anther tapetum is not completely conserved after the endoreduplication cycles. In fact, the loss of telomere association with the nuclear membrane has been documented in some special chromosome types, such as pigeon lampbrush chromosomes (Solovei and Macgregor, 1995) and Diptera polytenic chromosomes (Agar and Sedat, 1983). In plant polytene nuclei, however, this loss of telomeric association with the nuclear envelope was reported for the first time in anther tapetum polytenics (Guerra and Kenton, 1996).
These chromosomes have also helped in the identification of the 45S ribosomal sites in Phaseolus coccineus and Vigna unguiculata (Guerra et al., 1996), and 5S sites, in V. radiata and V. unguiculata (Carvalheira et al., 1998). In P. coccineus, six ribosomal sites were observed in tapetal cells, as has been reported previously (see Avanzi et al., 1972; Durante et al., 1977). Surprisingly, however, ten ribosomal sites were observed in V. unguiculata tapetum polytenics (Guerra et al., 1996), instead of one or two pairs as earlier reported (Frahm-Leliveld, 1965; Barone and Saccardo, 1990; Galasso et al., 1992). The large number of ribosomal sites observed in V. unguiculata when compared with Phaseolus has suggested that this increase in ribosomal sites may have been initiated by genetic mechanisms, such as gene conversion. According to Guerra et al. (1996), the variation in the number of rDNA sites observed between species of related taxa could be due to the differential amplification and fixation of rDNA sequences at different chromosomal sites. On the other hand, four 5S ribosomal sites were observed in V. radiata and V. unguiculata (Carvalheira et al., 1998), confirming the previous reports for V. unguiculata (Galasso et al., 1995), although these reports were first published for V. radiata.
In conclusion, although the polytenics of the anther tapetum are smaller than those in suspensor cells, both the large number of polytene cells in this tissue and their structural polytene morphology make these chromosomes more convenient for the study of plant polyteny and chromosome organization. Guerra and Carvalheira (1994) and Carvalheira and Guerra (1994, 1998) have suggested that such chromosomes present cycles of diffuse and condensed stages. The change from diffuse to condensed stage seems to depend on the endoreduplication level, genetic background and environmental factors. All these observations suggest that bundled polytene chromosomes of plants, at least in tapetal cells, are most probably the consequence of advanced endoreduplication cycles resulting in prophase or prophase-like chromosomes that may still be able to perform some DNA and RNA synthesis (Brady and Clutter, 1974; Cionini et al, 1982).